酒田町奉行所跡は戦国時代、一時最上義光が庄内を領有した時、高橋伊賀が住んでいました。
1622(元和8)年、酒井家入部後は御町代官と称していましたが、1624～1645(寛永年間)までには御町奉行所に改められ、以後明治維新に至るまで246年間、町政の役所として機能してきました。
現在の跡地は奉行所の裏側にあたり1,000センチ平方メートル程度ですが、当時の屋敷図では現在の5倍もの広さがあり、堀と土塁を廻らせ南端は新井田川に接していました。